儿科是目前恩阳区内唯一集儿童医疗、保健、科研、教学于一体的综合性科室，设置有儿科病区、新生儿病区。恩阳区危重新生儿救治中心，与四川大学华西第二医院建立长期紧密合作关系。

眼、耳鼻咽喉科承担辖区眼、耳鼻咽喉疾病诊治、面部头颈创伤急诊急救、预防保健、科研教学、征兵高考体检及残疾鉴定等工作任务； 科室现有医护人员共17人，其中副主任医师1名，主治医师4人，住院医师3人。 科室配备先进的耳鼻喉内窥镜检查系统、手术动力系统、低温等离子系统、电耳镜及微波治疗仪，电子咽喉镜检查系统、听力检测中心；眼科检查室配备裂隙灯、眼底镜、非接触性眼压计、角膜曲率仪、眼A、B超等；眼科手术室配备眼科手术显微镜、便携式高压蒸汽灭菌消毒仪等。

外一科集普外、胸外于一体的综合性科室，普外主要开展主要开展甲状腺、肝胆、乳腺、疝、胃肠、肛肠、血管外科等外科业务，胸外科主要开展肺、食道、手汗症、纵膈等业务，市级重点专科。

科室主要开展泌尿系统疾病、颅脑外科疾病等综合性外科业务。科室现有医护人员17人，其中副主任医师1人、主治医师2人、医师4人，专业护理人员9人。科室医务人员均曾多次到四川大学华西医院、四川省人民医院、第三军医大学第三附属医院进修学习。

手术室、麻醉科是医院临床科室的重要组成部分，承担着全院外科手术麻醉、术后镇痛、危急重症抢救等任务。科室现有医护人员13人，其中中级职称2人，初级职称11人。科室医务人员先后分别在海军总医院、巴中市中心医院等上级医院进行专科学习进修。

内一科是集心血管、神经内科专业、重症监护病房为一体的综合性病区，恩阳区高血压防治中心、心衰中心、防治卒中中心。 科内现有医护人员33名，其中主任医师1名，主治医师5名，医师6名，专业护士20人，科内医护人员曾在四川大学华西医院、四川省人民医院、川北医学院等医院进修学习。 科室配备有多功能床旁监护仪20台，进口多用呼吸机8台、多功能B超机、多功能除颤器、胸肺部物理治疗仪、微量注射泵、输液泵、床边心电图机、床边X光摄片机等先进医疗设备。

呼吸内科集呼吸、感染于一体的综合性科室，区级重点专科。 现有医护人员19名，其中副主任医师2名，主治医师2名，住院医师4名。 科室拥有奥林巴斯电子支气管镜、迈瑞有创呼吸机、飞利浦无创呼吸机V60、肺功能仪、多功能心电监护仪、空气压缩泵雾化吸入、振动排痰仪等医疗设备。

肾内科主要开展肾脏病诊治和血液透析治疗为一体的综合性科室，区级重点专科。科室现有医护人员20名，其中专科医师6名，专科护士10名。科内医护人员先后多次到“四川大学华西医院”、“四川省人民医院”、“重庆新桥医院”进行专科进修学习。

科室主要开展消化系统疾病、内镜下诊断和治疗等综合性内科业务。科室现有医护人员17人，其中副主任医师1人，主治4人，科室医务人员均曾多次到四川大学华西医院、四川省人民医院、北京海军总医院、成都军区总医院进修学习。

急诊科是一个跨多学科专业的一级临床科室，承担着医院院前急救，院内急诊等为一体的医疗急诊任务，并与巴中市急救中心联网，负责恩阳区内“120”接诊和院前急救、应急保障工作，以及各类危重病人的救治、转运、转诊。

骨科是集现代骨科和传统骨科于一体的综合性科室，承担着辖区内骨伤、骨病等运动系统疾病的医疗、预防、教学等任务。 科室现有医护人员16人，副高职称1人，中级以上职称4人，初级职称12人。科室医务人员均曾到海军总医院、重庆新桥医院、省人民医院、川北医学院附属医院进修学习。 科室配备有C型臂、骨科专用手术床、冷敷仪器、红光、烤灯治疗仪等先进治疗设备。

妇产科是集妇科、产科、计划生育服务等于一体的综合性科室，恩阳区危重孕产妇救治中心，区级重点专科，与四川大学华西第二医院建立长期紧密合作关系。

检验科是设有临检、生化、体液、免疫、微生物、PCR、输血等多部门一体的综合科室，承担着医院临床检验、输血、健康体检、科研教学等任务。 现有专业技术人员13人，本科以上学历5人，中级以上职称4人，初级职称7人。

放射科是集检查、诊断及辅助治疗为一体的综合性科室，承担着医院临床医疗、健康体检、科研教学等任务。

功能科是集超声、心电、脑电等于一体的综合科室，承担着医院临床辅助诊断、辅助治疗、体检等功能任务。 现有专业技术人员8人，其中副主任医师1名，主治医师5人，执业医师2人。科室人员先后分别到达州市中心医院、川北医学院附属医院、四川省人民医院、海军总医院等三甲医院进修学习。